Der Aufsichtsrat setzt sich aus den wissenschaftlichen Leitungspersonen der Gesellschafter des LPI sowie dem zuständigen Ministerialdirektor des BMBF zusammen. Er ist das zentrale Steuerungsgremium des LPI.
Engelbert Beyer
Ministerialdirektor des BMFTR
Aufsichtsratsvorsitzender
Prof. Dr. Jürgen Popp
Wissenschaftlicher Direktor des Leibniz-IPHT
Stellvertretender Aufsichtsratsvorsitzender
Prof. Dr. Thomas Kamradt
Wissenschaftlicher Vorstand des Universitätsklinikums Jena
Prof. Dr. Axel Brakhage
Wissenschaftlicher Direktor des Leibniz-HKI
Prof. Dr. Thomas Pertsch
Vizepräsident der Friedrich-Schiller-Universität Jena